Metil acetat šteti ljudskom tijelu: ima anestetičke i stimulativne učinke. Osobe izložene većim koncentracijama ovog proizvoda mogu uzrokovati simptome iritacije očiju, nosa, grla i respiratornog trakta. Ponavljani ili produženi kontakt s progresivnom anestezijom. Nakon prekida kontakta, oporavak je sporiji, ponekad uzrokujući neprozirnost rožnice. Može izazvati dermatitis i ekcem na koži. Izloženost parama ovog proizvoda može izazvati iritaciju očiju, zalijevanje, progresivnu dispneju, glavobolju, vrtoglavicu, palpitacije, depresiju i depresiju centralnog nervnog sistema.
Metanol nastao razgradnjom može uzrokovati gubitak vida, smanjenje vidnog polja i atrofiju optičkog živca. Velika koncentracija može uzrokovati anesteziju, zagušenje jetre i bubrega; kontinuirana velika inhalacija može izazvati akutni plućni edem. Hronični efekti mogu uključivati sekundarnu anemiju, leukocitozu, visceralnu zamućenost i steatozu. Povremeno ljudi koji su alergični na ovaj proizvod mogu prouzrokovati krvarenje desni zbog poremećaja vaskularnog nerva nakon male količine inhalacije.